A igreja do Seminário de Santa Joana Princesa faz parte do edifício do Seminário situado no lugar de Santiago.

O Seminário foi sonhado e inaugurado pelo primeiro bispo da Diocese restaurada, D. João Evangelista de Lima Vidal. Iniciou a sua actividade lectiva no dia 14 de Novembro de 1951.

O projecto arquitectónico do Seminário foi elaborado pelo grupo ARS, constituído pelos arquitectos Fernando Manuel da Cunha Leão, Mário Cândido de Soares Morais e António de Matos Fortunato Cabral, e insere-se no estilo Português Suave, muito característico de meados do século XX.

A igreja do Seminário foi a última parte do Seminário a ser completa, tendo a igreja sido dedicada ao culto em 1981. A execução final do projecto da igreja foi realizada no tempo em que o Padre Arménio Costa era Reitor do Seminário, tendo a obra de execução final sido da autoria do Arquitecto Aveirense Cravo Machado, o qual tem acompanhado generosamente até à data as obras de remodelação do Edifício.

Os vitrais e painéis cerâmicos são da autoria do artista aveirense Vasco Branco, os quais são alusivos à descida do Espírito sobre os Apóstolos e a Virgem Maria, assim como fazem referência a motivos eucarísticos.

O painel central assinala a descida do Espírito Santo sobre os apóstolos sobre os apóstolos e a Virgem Maria (cf. Act. 2). Este episódio marca o cumprimento da promessa de Jesus que enviará o Paráclito, o defensor. A partir deste momento os apóstolos vencem o medo dos judeus e saem para fora para anunciar o Evangelho.

Os quatro painéis assinalam motivos eucarísticos e cristológicos. Neles podemos observar:

Os dois peixes com que Jesus alimenta a multidão, ao mesmo tempo que podemos vislumbrar ora um lírio, ora uma ave – saliente-se que o pelicano é também símbolo da eucaristia;

O Cordeiro Pascal, figura que surge no livro do apocalipse, que identifica Jesus Cristo como o cordeiro sacrificado pelos pecados da humanidade;

O alfa e o ómega, primeira e última letra do alfabeto grego, e que simbolizam Jesus Cristo, como princípio e fim de tudo o que existe.

O peixe e os cinco pães, também alusivos à multiplicação dos pães realizada por Jesus;

O sacrário da igreja é inspirado nas rosáceas das janelas do Seminário e o seu desenho foi realizado pelo padre Manuel Silva Gonçalves da Fonte que integrou a comunidade formadora do Seminário nos anos 70 de século passado.

Espaço de oração para todos
A igreja do Seminário é um espaço destinado à oração, ao silêncio e ao encontro com Deus.
O Seminário procura ser na Diocese e na cidade de Aveiro um sinal da vocação cristã, ou seja, da resposta ao chamamento de Deus que nos chama a todos para o seguir, caminho que acreditamos responder aos mais profundos desejos da humanidade.
A igreja do Seminário está aberta durante a semana entre as 10 e as 18 horas. Para além de celebrações agendadas por grupos que rezam no Seminário, existe culto regular à quinta-feira e ao Domingo aqui ou numa das capelas interiores do Seminário.